La historia de nuestra hermandad se remonta a 1990, cuando un grupo de cuatro jóvenes devotos decidieron dar vida a esta comunidad religiosa. Su pasión por la Semana Santa los impulsó a fundar la hermandad, cuya primera imagen fue la Virgen de los Perdones, donada por las Hijas de la Caridad del pueblo, aunque sus orígenes exactos son desconocidos.
En sus inicios, en 1990, los cuatro jóvenes llevaron a hombros la imagen de la Virgen por la plaza del pueblo. Este ritual se repitió hasta 1994, cuando la hermandad realizó su primera procesión en la Semana Santa, específicamente el Martes Santo. La introducción del Cristo en la hermandad ocurrió en algún momento entre estos años, aunque no se tiene certeza del año exacto.
De 1994 a 1998, la Virgen y el Cristo fueron portados por grupos de 15 y 12 devotos respectivamente. Sin embargo, en 1998, la hermandad sufrió un devastador incendio que destruyó por completo la imagen de la Virgen y su paso. Ante esta tragedia, Salvador Madroñal se ofreció a esculpir una nueva imagen de la Virgen de forma gratuita, únicamente cobrando por los materiales.
El 18 de marzo de 1999, la nueva imagen, creada por el imaginero sevillano, fue bendecida. Posteriormente, debido a la restauración del retablo de la parroquia, la imagen del Cristo fue destruida y reemplazada por la actual, creada por Juan Manuel Miñarro.
En 1999, la hermandad estrenó un nuevo paso para la Virgen de los Perdones, convirtiéndose en la primera en la ciudad en procesionar un paso a costal. Previamente, ya había sido la primera en llevar una imagen en paso a hombro, ya que todas las imágenes procesionales se movían sobre ruedas. Aunque inicialmente el paso del Cristo también se portaba a costal, posteriormente se cambió a hombro.